"극한미생물학(저술중)" 카테고리의 글에 대해

이 카테고리의 글은 제가 공부한 "극한미생물학"을 정리하고 국내에 소개하기 위해서 쓰고 있는 책의 일부입니다. 물론 언제 완성이 될지는 모르겠습니다만

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링크나 다른 사이트에 소개하시는 것은 상관없습니다.

태터툴즈 블로그로 오기까지의 여정

92년도 말인가 93년도 초인가, 미국을 다녀온 한 실험실의 선배가 매뉴얼로 DNA 시퀀싱을 하고 그 결과를 일일이 타이핑하고 있는 제게 알려준 것이 바로 인터넷이라는 것이었습니다. 이메일이 무엇인지 홈페이지가 무엇인지 알아가며 그 신기한 세계를 접하게 된 것은 완전히 새로운 세계를 맛본 하나의 전환점이었습니다. 그리고 그 정점엔 바로 NCBI의 BLAST search가 있었습니다.

일일히 DNA 시퀀싱 gel로 부터 염기서열을 읽고, 누군가가 옮겨 적고, 그것을 타이핑하고 다시 그것을 컴퓨터 프로그램을 통해 일일이 맞춰보던 작업을 하던 제게 이 결과가 제대로 된 것인지 아닌지 알려주었던 것이 바로 BLAST 서치 였습니다. 그 이후로 인터넷으로 할 수 있는 전공관련 작업들을 하나 둘씩 모으기 시작했고, 어느새 그 쌓인 자료들을 인터넷 홈페이지로 만들기도 했었습니다.

키틴 키토산에 관한 연구를 할 때는 키틴키토산연구회 (현 한국키틴키토산학회) 홈페이지를 무단으로 만들어서 (당시엔 학회 홈페이지도 귀하던 시절이었으니까) 스캔을 떠서 자료를 올리기도 했었고 당시 일본에서 키토산 연구를 하시던 한상문 박사님의 웹사이트를 보면서 감탄을 했던 기억도 납니다.    

 

(어줍잖은 실력으로 만들었던 한국키틴키토산연구회 홈페이지 배너...^^)

하지만 유행에 민감한 것이 인터넷인지라 어느덧 홈페이지의 시대는 지나가고 카페와 미니홈피와 블로그의 시대로 바뀌어 오면서 좀 더 쉽고 편하게 자신의 자료를 다루고 사람들과 공유할 수 있는 방법들이 개발되었는데 그 중의 하나가 바로 태터툴즈를 이용한 블로그입니다.

또 언제 이런 유행이 가고 새로운 툴들이 나올지 모르겠지만, 처음 홈페이지를 만들었던 네띠앙이 망해서 나름 여러가지 귀한 자료를 잃어버린 경험이 있기 때문에, 적어도 테터툴즈를 이용하면 자료들을 백업하고 재활용하기가 상대적으로 쉽다는 장점에 혹해서, 그리고 조금은 비슷한 분야, 비슷한 관심사의 사람들과의 인터랙션을 기대하며 새로운 시작의 발걸음을 내디뎌 봅니다.

인터넷의 바다에 또 하나의 작은 돌멩이를 던지는 심정으로...
   

수퍼보울 전날에 본 <Remember the Titans>

수퍼보울이 방금 끝났다. 인디애너폴리스의 승리로. 독립기념일이나 크리스마스, 땡스기빙 같은 각종 기념일을 제외하고는 아마 가장 큰 명절(?)이라고 할만한 이 날이 지나간다는 것은, 약간 서글픈 일이다. 이로서 풋볼의 시즌은 전부 막을 내렸고, 다음주 올스타전이 열리는 NBA가, MLB가 시작할 때까지 여러 스포츠팬을 사로잡을 것이다.

(어메리칸)풋볼은 이상한 묘미를 주는데, 그 인기에 걸맞게 다양한 문화현상을 만들어낸다. 영화에 있어서도 마찬가지인데 미국은 풋볼에 관련한 영화가 참 많다는 것은 미국에 와봐야 알 수 있다. 그 중에 가장 유명한 영화의 하나가 바로 이 <리멤버 타이탄>(국내 개봉제목, 원제 Remember the Titans)이다.

버지니아주 알렉산드리아시에서 1971년 있었던 실화를 바탕으로 만든 이 영화는 덴젤 워싱턴이 풋볼 코치 허만 분 (Herman Boone)으로 출연하며 영화 <아마게돈>으로 친숙한 윌 패튼이 디펜시브 코디네이터인 빌 요스트 (Bill Yoast)로 출연했다.

1971년은 흑인 민권운동의 절정에서 불의의 죽임을 당한 마틴 루터 킹 목사가 죽은 지 삼년이 지난 해이며 그런 흑인 인권운동의 여파로 남부 버지니아(그런데 왜 버지니아를 남부라고 할까, 사실은 거의 중부인데)의 알렉산드리아 시에서 흑백이 함께 다니는 공립학교를 새로 만들고 (기존의 학교를 합병?) 흑인 코치 허만 분 (덴젤 워싱턴)을 코치로 임명하는 데서부터 이야기가 시작된다.

상습적이라고 할 수 있는 흑인 코치에 대한 백인들의 조직적인 반란, 코치직을 빼앗기고 2인자로 내려앉은 빌 요스트의 갈등, 하지만 운동을 통하여 점점 하나가 되어가는 선수들, 그리고 승리, 또 승리, 결국은 그것을 통한 흑백의 화합... 뭐 이런 이야기다. 게다가 이 영화는 디즈니의 영화라는 것을 일단 참조하시라.

하지만!!! 그럼에도 불구하고, 이 영화는 상당히 먹힌다. 그건... 풋볼이 주는 힘이 아닐까 생각한다. 어느 블로거가 "아니 미국은 고등학교 풋볼 하나로 수백년 묵은 흑백 갈등이 풀리는가?" 이렇게 이야기를 했지만, 그건 풋볼의 위력을 몰라서 하는 말이다. 만일 동네 고등학교가 그 시즌에 전승하고 내셔널 챔피언십에 나간다면? 그건 우리가 상상하는 그 이상이 될 수도 있다. 물론 그렇다고 흑백 갈등이 "완전히" 없어진다는 것은 아니다. 완전한 것은 없다. 아직도 KKK 하는 놈들이 있는 세상이다.

실은 이 포스트를 쓴 이유는, 좀 다른데 있는데, 영화에 보면 처음으로 흑백 선수들이 함께 합숙훈련을 간다. 그런데 흑인 선수 주인공인 줄리어스가 자기 침대 옆에 그림을 한 장 붙이는데, 과거에는 무슨 포스터인지 몰랐으나 그 그림이 바로 이 그림이었기 때문이다.

바로 아래 포스트에 썼지만 1968년 멕시코시티 올림픽 남자 육상 200미터 시상식에서 미국의 토미 스미스(금메달)과 죤 카를로스 (동메달)가 흑인 민권운동에 대한 의미로 검은 장갑을 끼고 미국국가가 연주되는 동안 고개를 숙이고 손을 들고 서 있었던 사진이다.

1968년, 그해 4월 4일에 마틴 루터 킹 목사가 테네시에서 암살당했던 바로 그 해 가을에 멕시코시티에서 올림픽이 열렸고 10월 17일 200미터 결승에서 우승한 두 선수가 다음과 같은 퍼포먼스를 한 것이다.

(여담이지만 사실 카를로스는 검은 장갑을 잊어먹고 안가져와서 토미 스미스의 것 한 짝을 얻어서 끼었다고 한다. 그래서 스미스는 오른손을, 카를로스는 왼손을 들고 서 있는 것이다. 장갑을 나누어끼는 아이디어를 제공한 사람은 은메달리스트인 호주의 피터 노먼이었고 노먼도 가슴에 OPHR (Olympic Project for Human Rights) 밷지 (왼쪽 가슴에 달린 동그란 하얀 밷지)를 달고 시상식에 나왔다.)

흑백갈등은 아직도 미국 사회에 잠재적인 문제이지만, 지금 미국 할머니 할아버지가 보기에는, 특히 남부의 사람들이 보기에는 정말 "세상 많이 좋아진" 것 일 수 있다. 그네들이야 버스도 함께 안타고, 식당에서 흑인들과 같이 식사하는 것은 있을 수 없는 일이었을테니까.

아무튼, 그런 여러가지 생각을 하면서 볼 수 있는, 나름 재미있는 영화가 바로 이 <리멤버 타이탄>이다. 물론 풋볼을 알고 봐야 더 재미있다.

[논문영어] immense = inconceivable (헤아릴 수 없는)

고든의 비만과 장내세균에 관련된 논문을 읽다가...

The human gut contains an immense number of microorganisms
(인간의 장에는 아주 많은 미생물들이 살고있다.) ==> 2004 PNAS paper

= The adult human intestine is home to an almost inconceivable number of microorganisms. ==> 2005 Science paper

= Trillions of microbes live in the human gut ==> 2006 Nature paper

나라면 a great number of 정도를 사용하지 않았을까??? 틀린 표현은 아니지만 좀 더 과학적으로 멋나게 쓰려면 immense 가 좋아보인다.

immense ［ｉｍ´ｅｎｓ］ 거대한, 막대한, 광대한(huge), 이루 헤아릴수 없는, 한없는, 멋진, 굉장한, -ly막대(광대)하게, (속)아주, 굉장히, -ness

The professor was revered for his immense learning.
그 교수는 방대한 학식을 지녀서 공경을 받았다.

그 저명한 철학자에게 경의를 표하는 거대한 기념비가 세워졌다.
An immense monument was erected in honor of the eminent philosopher.

[논문영어] not amenable to : 안되는...

최근에 Nature Methods에 낸다고 우리 보스가 쓴 문장...

proteins not amenable to expression in bacterial hosts

나 같으면
Proteins (which is) not well-expressed in bacterial hosts
라고 했을텐데...

* amenable ［∂ｍ´ｉ:ｎ∂ｂ∂ｌ］ 복종해야 할, ...을 받아들이는, (충고 등에)순종하는

위의 사전적인 해석으로는 뜻이 잘 안통하고 그냥 "안되는" 정도의 의미지만 죽었다 깨어나도 내가 만들어서 쓰기 어려운 표현...

[논문영어] thrive at : 번창하다, 잘 자라다

Grow well 이런 말 쓰지말고 thrive!!!

Pyrococcus furiosus thrives at extreme temperatures

* thrive 번창하다, 번영하다, 무성하다, 호황을 누리다

By studying fossils, paleontologists learn what forms of life thrived during various periods of the Earth's history.
(화석을 연구함으로써, 고생물학자들은 지구역사의 여러 가지 기간 동안에 어떤 형태의 생명체가 번창했는지를 배운다.)

엄석대 그 후, 희망은 있는가?

여기 이문열의 소설이 있다. <우리들의 일그러진 영웅>. 문학전문기자 최재봉의 글을 빌려서 내용을 요약해본다.

철저한 독재자인 반장 엄석대의 배후에는 그의 `효율적인 통치'에서 득을 보는 담임선생님이 있다. 그러나 주인공들이 5학년에서 6학년으로 진급하면서 새로 담임을 맡게 된 교사는 엄석대 식의 강압적인 반 운영을 비판하고 구성원들의 자율적이고 민주적인 참여를 요구한다. 결국 전교 1등의 성적까지 조작하는 엄석대의 음모를 발각해낸 교사에게 매를 맞고 엄석대는 학교를 떠난다. “너희들은 당연한 너희들의 몫을 빼앗기고도 분한 줄 몰랐고, 불의한 힘 앞에 굴복하고도 부끄러운 줄 몰랐다.” 엄석대와 그의 공모자들에게 매를 때리면서 교사가 한 말이다.

여기 유사한 줄거리의 또 하나의 소설이 있다. 황석영. 이문열과 대척점에 서있는 사람이다. 1972년에 나온 이 소설의 제목은 <아우를 위하여>. 역시 최재봉의 요약이다.

열한 살짜리 주인공 수남의 반에 열다섯 살짜리 영래가 새로 들어오면서 힘으로 반장 자리까지 차지하게 된다. 가르치는 데에는 뜻이 없고 부업 때문에 밖으로만 나도는 담임선생님은 은근히 영래가 반을 휘어잡는 것을 달가워한다. 그러나 영래의 횡포가 우심해지고, 처음에는 그를 따르던 아이들조차 점차 그에게서 멀어질 무렵, 사범학교 졸업반인 교생 선생님이 부임해 온다. “한 사람이 잘못 생각하고 있었다면 여럿이서 고쳐줘야 해요. 그냥 모른 체하면 모두 다 함께 나쁜 사람들입니다”라는 그의 말에 수남이와 반 아이들은 힘을 합해 폭군 영래를 몰아내기에 이른다.

눈치 빠른 사람들은 두 소설의 얼개가 상당히 비슷하면서도 결론이 정반대임을 알아챘을 것이다. 마지막 최재봉의 결론이다.

엄석대와 그의 공모자들에게 매를 때리면서 교사가 한 말에서는 앞서 인용한 수남이네 교생 선생님의 말이 겹쳐 들린다. 차이가 있다면 <아우를 위하여>에서는 교생 선생님의 격려를 받은 아이들이 스스로 폭군을 몰아낸 반면, <우리들의 일그러진 영웅>에서는 교사가 직접 행동에 나섰다는 점뿐이다. 두 작품 모두 정치적 알레고리로서의 색채가 뚜렷한데, <아우를 위하여>가 폭군에 맞서는 민중 쪽의 대의에 초점을 맞춘 반면, <우리들의 일그러진 영웅>에서는 석대가 몰락한 뒤 반 아이들이 보인 행태를 통해 그들의 우중(愚衆)적 면모를 표 나게 드러내고 있다.

(최재봉의 컬럼, “우리들의 진짜 영웅은?” 중에서)

황석영과 이문열. 어느 것이 더 진짜 현실에 가까울까? 난 이문열의 소설이 더 현실적이라고 생각한다. 누구든 힘센자에게 맞서기 보다는 순응하는 것을 훨씬 보기 쉬운 세상이다. 더욱이 진보라는 것이 사람들에게 허상이었다고 여겨지는 요즘에 말이다.

하지만 희한하게도 세상은? 황석영의 방향으로 움직이고 있다. 쉽게 느끼지 못할 정도로 서서히, 그러나 확실하게 그렇다. 정점에 몰렸던 권력은 점점 그 영향력이 퍼져가고 있고 민중 또는 대중의 목소리는 그 어느 때보다 높다. 어른들이 위아래도 없는 이놈의 세상이 망할 것 같다고 말씀하실 정도로 말이다. 물론 한 때 젊은이들이 꿈꾸었던 꿈, 자유와 희망이 넘쳐흐를 대동 새세상에는 충분히 못 미치지만 말이다.

하지만 돌이켜 보시라. 인류의 역사까지 갈 것 없이, 우리의 역사에서 지금처럼 개인의 자유와 인권이 보장된 적이 얼마나 있었는가를. 이걸로 만족하자는 이야기가 아니다. 언제나 싸움은 이문열(현실)이 이기는 것 같은데 역사의 수레바퀴는 황석영(꿈)쪽으로 굴러오는 것은 사실이다. 희망은 현실이 아닌 현실 너머에 있기 때문이다.

사람들이 희망이 없다고 말한다. 그러면 영화 쇼생크 탈출을 한 번 더 보시라고 권해주고 싶다. 자유에 대한 희망을 가진 앤디 (팀 로빈스), 감옥의 익숙함에 동화되어 자유를 포기하고 자살한 브룩스, 그 둘 사이에서 앤디의 희망을 선택한 레드 (모건 프리먼)가 앤디와 그 푸른 바다와 하얀 백사장의 “지후아타네호 (Zihuatanejo)”에서 만나는 장면을 말이다.


희망은 우리가 품느냐 버리느냐의 문제이지, 있느냐 없느냐의 문제가 아니다. 물론 품는다고 다 이루어지는 것은 아니지만 말이다. 분명한 것은 지금 “현실”에 동화되어 있는 사람에게 희망이란 어색한 단어라는 점이다.

바로 그 현실, 이문열이 소설 속에서 현실감 있게 그린 그대로, 엄석대가 사라진 지금 우리의 모습은 완전히 지리멸렬이다. 나눠가진 권력으로 서로 물고 뜯는 싸움이 시작되었다. 여와 야가 싸우고, 법원과 검찰이 싸우고, 정치권력과 언론이 싸우고, 친북과 반북이 싸우고, 민중과 우중이 싸운다. 싸움에 진절머리 치는 당신, 충분히 이해한다. 하지만 어쩌겠나, 그것이 현실인 것을. 진정 희망을 잡으려면 그 현실을 넘어서야 하는 것을, 여기서 멈추어선 정말 희망이 없는 것을, 쉬었다 가더라도 때론 좀 돌아가더라도 진도는 나가야 하는 것을, 말이다.

나에겐 아직도 희망이 있다.